上海**口腔医学院的前身是震旦**牙医系，创建于1932年。1952年9月，全国高等学校院系调整，由圣约翰**、同德医学院与震旦**合并，成立上海**医学院，牙医系则改称为上海**医学院口腔医学系，这是新中国成立初全国最早建立的4个口腔医学系之一。1987年10月，改名为上海第二**学口腔医学院。2005年7月，上海第二**学与上海交通大学合并，同年10月，随之更名为上海交通**医学院。
上海交通**医学是教育部首批高等学校特色专业建设点，教育部“211工程”重点学科，教育部“双一流学科”，上海市高峰学科建设，上海市地方高校高水平建设学科。口腔临床医学是国家级重点学科、口腔基础医学是国家级重点（培育）学科和上海市重点学科。口腔颌面外科、口腔修复科、牙体牙髓病科、牙周病科、口腔正畸科和口腔黏膜病科为国家临床重点专科，**黏膜病学是国家中医药局重点专科。口腔学科在多项权威评价榜单中继续保持中国口腔学科第一方阵前列。
上海交通**医学院不仅是国家口腔疾病临床医学研究中心，也是国家口腔医学中心，上海市重中之重临床医学研究中心建设单位。此外，学院拥有全国科普教育基地、中国医学**口腔医学创新单元、上海**医学研究所、上海**医学重点实验室、上海**疾病临床医学研究中心、上海口腔医学先进技术与材料工程技术研究中心、5个上海市专业技术服务平台、上海市头颈肿瘤诊治和转化医学中心、上海-悉尼联合研究中心—生物工程与再生医学联合实验室、上海-新西兰口腔医学联合实验室—口腔颅颌面基础与临床研究中心和上海交通大学转化医学研究院下属的“转化医学口腔健康创新中心”和“头颈肿瘤数字诊治创新技术研究中心”。
有近30所境外姐妹学校，每年选派学生前往美国、瑞典、日本等地进行交流学习。先后与13所国际知名院校开展了广泛的科研合作和师生交流，拓展学生国际化视野，提升学生综合思维素质。毕业生成功申请美国北卡罗来纳大学、澳大利亚悉尼大学、荷兰Leiden大学、加拿大麦吉尔大学等境外学校，继续攻读硕士或博士学位。
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